第1章 緒論

1.1 系統(tǒng)生物學(xué)的產(chǎn)生背景；1.2 系統(tǒng)生物學(xué)的定義和研究內(nèi)容； 1.3 系統(tǒng)生物學(xué)的應(yīng)用前景

第2章 生物學(xué)基礎(chǔ)

2.1 生命的起源與進(jìn)化；2.2 細(xì)胞結(jié)構(gòu)與物質(zhì)代謝； 2.3 分子生物學(xué)中心法則；2.4 細(xì)胞周期與胚胎發(fā)育

第3章 系統(tǒng)科學(xué)基礎(chǔ)

3.1 系統(tǒng)概述；3.2 系統(tǒng)建模；3.3 系統(tǒng)仿真；3.4 系統(tǒng)科學(xué)精要

第4章 數(shù)學(xué)基礎(chǔ)

4.1 線性代數(shù)；4.2 微分方程與差分方程；4.3 圖和網(wǎng)絡(luò)理論； 4.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)與隨機(jī)過程

第5章 實(shí)驗(yàn)技術(shù)

5.1 基本技術(shù)；5.2 高通量技術(shù)；5.3 轉(zhuǎn)基因生物、RNA干擾；5.4 四維顯微觀測技術(shù)

第6章 計(jì)算技術(shù)

6.1 程序設(shè)計(jì)技術(shù)； 6.2 數(shù)據(jù)庫技術(shù)；6.3 網(wǎng)絡(luò)技術(shù)；6.4 平行計(jì)算技術(shù)

第 7 章 生物信息資源

7.1 常用數(shù)據(jù)庫； 7.2 常用的算法和網(wǎng)絡(luò)服務(wù)；7.3 常用的建模工具

第 8 章 “組學(xué)”概述

8.1 基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、糖組學(xué)；8.2 相互作用組學(xué)；8.3 代謝物組學(xué)；8.4 表型組學(xué)、系統(tǒng)組學(xué)

第 9 章 系統(tǒng)生物學(xué)的模型與仿真

9.1 代謝； 9.2 信號轉(zhuǎn)導(dǎo)；9.3 生物過程建模； 9.4 基因表達(dá)與調(diào)控；9.5 虛擬細(xì)胞與合成生物學(xué)

第 10 章 系統(tǒng)水平分析

10.1 魯棒性分析；10.2 反饋分析；10.3 流分析

第 11 章 系統(tǒng)生物學(xué)展望